Flyme系統是自帶了開放系統權限的功能的，即允許第三方軟件獲取Root權限，但是大家也要注意開放系統權限以後，有利的方面是：手機的可玩性增大，手機管家們終於可以靜默安裝程序了，各種以前不能使用的軟件功能也可以使用了，另一方面，安全性降低，穩定性變弱，更重要的是你很可能已經放棄了公司的三包政策。
國際上大部分手機廠商，包括蘋果、三星等都規定不會給ROOT後的手機保修，當然魅族也不例外，就曾在微博上表示不會給ROOT後的手機保修，並且會上載手機的唯一識別碼和ROOT記錄。但也有人ROOT後還享受保修的，那就是福利了。《系統權限開放申請》如圖：
（01）打開“設置”----“賬户”，（如果還沒有註冊flyme賬號，可以到魅族官方網站冊一個，也可以在手機使用手機號登陸），如圖：
（02）點擊“更多”，然後進行如下界面，其中有一個選項是“開放系統權限”。如圖：
（03）點擊“開放系統權限”，彈出如下申請窗口。（注：小編在這裏提示一下大家，要認真閲讀提示窗口內的文字，決定後，選擇“同意接受以上內容”，然後點確定。
（04）這時會彈出flyme賬號的密碼驗證窗口，輸入你的密碼，系統會自動重啟，重啟後，系統就處於ROOT成功了，開機進入剛才的"開放系統權限“，已經顯示“已開放系統權限”，如圖。
（01）到安卓市場裏下載一個權限管理軟件，注意下載那些下載量非常大的官方正版軟件。
（02）在授權管理中對系統的各種權限進行管理，權限主要可以分為root權限，隱私權限。ROOT權限是根權限，系統最高權限，要重點關注ROOT權限授給了哪些軟件。
（01）安裝手機衞士，並打開，如果提示需要ROOT權限，則授權。點擊“應用管理”
（02）然後點擊下圖中的“應用卸載”。
（03）在系統軟件中找到“授權管理”，然後卸載或停用。
（01）在魅族官方網站Flyme下載頁面中，下載bin格式的刷機文件，下載的時候，要注意適配自己的機型以及版本號：如果你喜歡嘗試新鮮事物，可以下載體驗版，如果你可以注重穩定，則可以下載穩定版。
（02）在下載過程中利用等待的時間對手機進行備份。（例如小編使用運用寶進行備份。）
（03）備份完，而且flyme系統文件bin下載完後，找到bin文件，拷貝至手機內存。
（04）將手機關機，並同時按電源鍵和音響下鍵重啟，這時有2個選項，一個是更新系統（這種情況下，系統會自動檢索內存中的BIN文件，不用自己選擇）：另一個菜單是擦除系統數據。小編選擇的是第一個，選擇完，手機就會自動升級。
（05）刷機重啟後，系統又回到了非開放系統權限的狀態。如圖：
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