雞糞的加工處理方式多種多樣，有物理方法、 化學方法、微生物發酵法、多種方式綜合法，其洋法與土法、古老與現代並存，各有優劣，應因地制宜。雞糞發酵作肥料的傳統老辦法是，讓其自然堆積發酵5~6個月，這樣臭味散發,既污染環境又造成養分大量流失。而用微生物發酵法處理雞糞，不僅能加快發酵過程，縮短髮酵時間，防止浪費提高雞糞的營養價值；而且能通過發酵產生温度烘乾雞糞，節省能耗，成本低廉，操作簡單，易於推廣，因而越來越得到人們的重視。
發酵原料：健康新鮮的雞糞（最好為肉雞雞糞，營養價值較高）。
原料為雞糞，但雞糞有幹雞糞和鮮雞糞之分，下面我們説下它們的發酵方法：
1、幹雞糞：由於幹雞糞中缺乏水分無法發酵，必須加足水分後，加足水分後，堆成大堆，再發酵，上蓋密封塑料布，這樣發酵會快些。
2、鮮雞糞：如果是鮮雞糞，發酵時還需要添加各種輔料，來進行吸收鮮雞糞中的水分，太多水分容易導致不透氣，微生物不能產生髮酵作用，輔料選擇多種多樣，目的就是能吸收部分鮮雞糞中的水分。輔料一般選擇：鋸末、秸稈、草灰碳等等。添加的比例約：70％的雞糞，30％的輔料就可以了，這個比例的調節要按當地的土質，營養成分來酌情調配。做果樹肥料，動物飼料的，須添加菌種等。菌種市場上賣的都有。
（01）配方一：幹雞糞1000公斤，雞糞發酵劑菌種0.25公斤,
（02）配方二：濕雞糞700公斤，麥麩或稻糠或秸稈粉300公斤，雞糞發酵劑菌種0.25公斤
（03）①將發酵原料按配比準備，此為發酵原料待用；② 將雞糞發酵劑菌種0.25公斤倒入水中稀釋攪拌均勻，稀釋用水最好為井水或河水，攪拌10-30分鐘；③ 如有攪拌機：可以先將雞糞混合2分鐘後，再倒入菌種稀釋液攪拌6分鐘；沒有攪拌機：用鐵鍬攪拌按由少到多的原則，即先將菌種稀釋液倒入少量發酵原料中攪拌均勻，直到沒有團塊，然後再將攪拌好的少量發酵原料倒入剩餘發酵原料中攪拌均勻，直到沒有團塊；在原料中加入發酵菌，混合均勻，堆成約1米、寬不超過1.5-2米，長度不限的堆。水分控制在40%左右（注意：視發酵原料乾濕程度增減稀釋用水水量，稀釋的菌種用水應是發酵原料的35%-40%左右，拌成以手握成團，指縫見水但不滴水珠，鬆手即散為好。注意：水多了易酸，少了發酵不透。如發酵原料較濕，應減少稀釋的用水量）；並在堆頂打孔通氣；最後用長方形塑料布將肥堆覆蓋，塑料布與地面相接，隔1米壓一重物，使膜內既通風又避免被大風鼓起。
（04）雞糞發酵時間：冬季一般一個月以上，夏季一般1-2個週期約14-21天左右。
（05）發酵後的用途1、可以用來養殖魚蝦，不污染水質，既可以作為魚蝦飼料，又可以作肥水產品；2、可以用來養殖黃粉蟲、蠅蛆、蚯蚓建立生態養殖模式；3、可以製作種植、花卉等生物有機肥。
1.雞糞鬚髮酵，腐熟，才能在農作物上使用，否則雞糞中某種病原微生物，會把作物的根系燒壞。烘乾與晾曬都可以，但晾曬後，雞糞的營養會損失一部分，雞糞經過烘乾機烘乾，可以達到烘乾目的，也可以達到除臭的目的。也可以減少人工的勞動強度等等。
2.烘乾後的水分冬季控制在約25％，夏季約15％，以防後續工序無法完成，有的烘乾機不能控制烘乾雞糞的含水量，而導致雞糞顆粒有機肥放置後繼續發酵。
3.夏、秋季節早晚要揭膜通風一次（1～2小時），天氣晴朗時可在頭天傍晚揭膜，次日早上覆蓋。堆漚4～6天后，堆温可升至60～70℃。堆漚10天后可翻堆一次，堆漚20天即能熟透，肥分提高，消滅有害蟲。
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